Estudio de aguas residuales detecta gran ola silenciosa en Bangalore

El recombinante XBB.1.16 Omicron detectado por primera vez en India el 25 de diciembre de 2022 se ha convertido en la variante dominante en el país. Con base en 2856 secuencias genómicas indias publicadas en GISAID entre el 1 de diciembre de 2022 y el 8 de abril de 2023, un equipo dirigido por el Dr. Rajesh P. Karyakarte, Jefe del Departamento de Microbiología del BJ Medical College, Pune, descubrió que el XBB.1.16 línea había aumentado de 9,3% en la primera semana de febrero a 79,17% en la primera semana de abril. EL resultados del estudioque aún no ha sido revisado por pares, se ha publicado en el servidor de preimpresión medRxiv.

El número de casos en India detectados a través de pruebas RT-PCR comenzó a aumentar lentamente en la primera semana de marzo y alcanzó un pico el 19 de abril con 12.591 contagios y una tasa de positividad de la prueba diaria del 4,39%. Dado que las pruebas diarias siguen siendo muy bajas, el número de casos detectados no refleja la propagación real de la variante XBB.1.16.

En contraste, el monitoreo ambiental realizado mediante el análisis de muestras de aguas residuales de 28 plantas de tratamiento de aguas residuales repartidas por Bangalore por el Instituto Tata de Genética y Sociedad (TIGS) ha revelado el verdadero alcance de la propagación del virus en la ciudad. Una muestra tomada una vez por semana de cada una de las 28 plantas de tratamiento muestra que los fragmentos de ARN que se encuentran en las aguas residuales comenzaron a aumentar desde principios de marzo y alcanzaron su punto máximo el 1 de abril.

En su apogeo, había más de 80.000 copias de virus por ml en la ciudad. Esto significaría que miles de personas se han infectado solo en Bangalore.

Muestras de aguas residuales

“Solo encontramos fragmentos de ARN del virus y no la partícula del virus en sí en las muestras de aguas residuales. Dado que un individuo infectado puede eliminar 10 millones de copias, es posible calcular el número de personas infectadas teniendo en cuenta el volumen total de aguas residuales tratadas en cada planta”, explica el Dr. Rakesh Mishra, Director de TIGS, que ha tomado medidas ambientales. Vigilancia del SARS-CoV-2 en Bangalore desde agosto de 2021.

“Parece que Bangalore fue testigo de una ola invisible de COVID-19 que fue mucho más grande que la tercera ola causada por las variantes BA.1 y BA.2 Omicron en enero de 2022”, dice. Y este debe ser el caso en toda la India, ya que XBB.1.16 se había extendido por todo el país entre marzo y abril. Hubo otra ola silenciosa en Bangalore en junio de 2022, impulsada por una de las variantes de Omicron.

«Dado que las plantas de tratamiento de aguas residuales están repartidas por todo Bangalore, podemos determinar qué área de la ciudad tiene la mayor cantidad de personas infectadas midiendo la carga de patógenos. El monitoreo de las aguas residuales puede proporcionar una imagen granular de las infecciones en Y ayudará a asesorar y advierta a los funcionarios de la ciudad sobre cualquier patrón nuevo o aumento de infecciones, incluso cuando no sea evidente”, dice.

Reluctancia

No solo ha disminuido drásticamente la cantidad de pruebas diarias, sino que las personas se han vuelto reacias a hacerse la prueba incluso cuando los síntomas son evidentes. En muchos casos, las personas infectadas permanecen asintomáticas.

El análisis de aguas residuales es una forma activa de monitoreo ambiental y ha estado vigente durante décadas en el caso de la poliomielitis. Proporciona una medida bastante precisa de la carga de patógenos en las aguas residuales y, por extensión, la extensión de la propagación del virus en la comunidad. La mayor ventaja es que el monitoreo de aguas residuales no requiere que las personas infectadas sean analizadas o que existan instalaciones de prueba. Analizar las aguas residuales en busca de fragmentos de ARN también es bastante fácil.

“Compartimos los resultados del monitoreo de aguas residuales con las autoridades municipales (BBMP) semanalmente. Pudimos realizar este seguimiento gracias a la voluntad de las autoridades cívicas”, explica el Dr. Mishra. «Con el virus SARS-CoV-2 aquí para quedarse, y el virus continúa evolucionando, es esencial realizar un monitoreo ambiental en cada ciudad durante los próximos dos años».